Fruto do trabalho de recolha e tratamento de artefactos arqueológicos terrestres e subaquáticos, o Museu de Arqueologia, inaugurado em 24 de outubro de 2008, é o culminar da evolução dos projetos de escavações levadas a cabo entre 1992 e 2002, pelas empresas Afrimar e Arqueonautas Worldwid, num espaço que iniciou como Centro de Conservação e Restauro, evoluiu para Núcleo Museológico da Praia, até chegar a configuração atual. O espólio é formado essencialmente por coleções de instrumentos de navegação, estrutura do navio (janela, governadora de leme, roldana, pinos, etc).